Kurze Genomwiederholungen Zeigen Affinität Zwischen Schweinen Und Primaten

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Kurze Genomwiederholungen Zeigen Affinität Zwischen Schweinen Und Primaten
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Anonim
Kurze Wiederholungen im Genom zeigen die Beziehung zwischen Schweinen und Primaten - Schweine, Schweine, Primaten
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Wissenschaftler fanden in Schweinegenom eine Familie einzigartiger kurzer Wiederholungen mit evolutionären Ähnlichkeiten zu ähnlichen Wiederholungen bei Primaten.

An dem Projekt nahmen in Zusammenarbeit mit der Firefly BioWorks Corporation (USA) Wissenschaftler der Jilin University (Changchun, China) und der Academy of Agricultural Sciences (Heilongjiang, China) teil.

Nach der Analyse der Struktur und Herkunft von PRE-1 (porcine repeat element, wörtlich "pig repeating element") kamen sie zu dem Schluss, dass die nächsten Verwandten von Primaten auf dem ehemaligen Superkontinent Laurasia Schweine sein könnten. Der Forschungsvordruck wurde am 31. August 2015 auf dem bioRxiv-Server veröffentlicht.

Das untersuchte CDP (Short Dispersed Repeat) PRE-1 befindet sich in der intergenen Region, ungefähr 686 ~ 985 Basenpaare vor dem Start des Gens, das für das Insulin-Wachstumsfaktor-Bindungsprotein (IGFBP7) kodiert. Die wiederholte PRE-1-Sequenz von 299 Basenpaaren wurde mit 40 verschiedenen Primaten-Alu-Wiederholungen verglichen, und es wurden signifikante Ähnlichkeiten sowohl in den Sequenzen selbst als auch im Muster der Verteilung ihrer Wiederholungen über die Chromosomen gefunden.

Die vorhergesagte Sekundärstruktur von RNA-Wiederholungen PRE-1 gefaltet in ein Modell ähnlich Alu-Wiederholungen. Schließlich deutete der gemeinsame Ursprung von PRE-1 und Alu aus der sogenannten 7SL-RNA (Signalerkennungs-RNA) auf ihre evolutionäre Ähnlichkeit hin und ordnete die Schweine der Familie zu, zu der hauptsächlich Primaten gehören.

Um phylogenetische Bäume zu erstellen, verließen sich Wissenschaftler bisher nur auf die Ähnlichkeiten und Unterschiede der Gene und ignorierten die Tatsache, dass das gesamte Genom im Laufe der Evolution Veränderungen erfahren hat, einschließlich der Elemente, die keine Proteine oder RNA kodieren und deren Bedeutung ist Wissenschaftlern noch weitgehend unklar.

Diese Studie, die auf einem integrierten Ansatz zur Analyse intergenerischer Elemente basiert, liefert laut den Autoren "sehr überzeugende" Fakten, aus denen sich evolutionäre Schlussfolgerungen ziehen lassen. Insbesondere verschiebt sich nach diesen Ergebnissen die geschätzte Zeit der Divergenz der Arten von vor 65 auf 80-100 Millionen Jahre.

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